现在植物学研究中，叶绿素荧光仪是一个很重要的研究工具。该仪器是很理想的野外研究应用仪器，能够实现非破坏性测量。数据可以直接记录在内存中，数据很容易下载并进行简单分析。还可以做温室培养，作物病害评估，环境评价，园艺学，农学，林学，水生物学，毒理学，突变株筛选，遗传育种等。

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手持式叶绿素荧光仪植物生理生态研究，其能量的传递与分配、反应中心的状态，过剩能量的耗散以及反映光合作用的光抑制和光破坏。应用叶绿素荧光可以对植物材料进行原位、无损伤的检测，且操作步骤简单。所以叶绿素荧光越来越受到人们的青睐，在光合生理和逆境生理等研究领域有着广泛的应用。